Az új mutánsok (vagy ahogyan a teknőcök hívják őket, Mewbie-k) kezdtek beilleszkedni, már a városlakók is befogadták őket, de aztán néhány lény ámokfutásba kezdett. A csatornáktól a felhőkarcolókig sehol sincs menedék attól, ami a városban folyik. Biztos, hogy a TCRI Corp. keze van a dologban! Senki sem segíthet a helyzeten, csak a négy félelmet hírből sem ismerő teknős tesó, akik egyedi nindzsa-mozdulataikkal képesek lehetnek megálljt parancsolni a városban folyó őrületnek, mielőtt az emberszabású-mutánsokkal nehezen felépített jó kapcsolatnak végleg befellegzett. Mozgass meg minden követ ebben az adrenalin-dús akciójátékban, mentsd meg a város lakosságát April és Splinter (Szecska mester) segítségével.
